生物除臭法的个阶段为预处理，预处理包括将废气，臭气通入仪器，将先废气，臭气中明显的杂质去除，以及给废气臭气为调节相应的温度以及相应的湿度，以更好的适应下一阶段的进行。
生物除臭法的第二个阶段是接触生物填料。在滤池中将特种微生物菌种附着于填料上，然后将污染物气体通过管道引导至填料表面。喷淋塔不断地向滤池内喷水，废气臭气与水或固相表面的水膜相接触，使污染物溶于液相的分子或离子中，废气臭气就被填料表面的水分吸收转化成污水，实现气相到液相的转变，这一过程遵循亨利定律。这一阶段在生物填料上进行，目的是将臭气中包含的化学物质通过填料由气相转化为液相，再由液相扩散进入到生物填料上的生物膜中。
生物除臭法的第三个阶段是生物氧化阶段。通过生物填料表面生物膜中包含的微生物将恶臭气体分子氧化，然后被微生物菌种吸收、消化代谢成为自身生长所需要的营养物质。微生物菌种可以从恶臭污染物气体中获得营养物质，在特定的温度和湿度条件下，微生物菌种快速生长、繁殖，在填料表面逐渐发展为微生物菌群。污染物臭气持续不断地从附着微生物菌群的填料表面通过，持续不断地被分解，终形成二氧化碳、水或是矿物质等，从而消除了臭气污染。
玻璃钢结构的生物除臭箱除臭原理是在适当的温度下培养能够分解恶臭气体成分的微生物，利用这种能够分解的微生物对于废气，臭气中的恶臭分子以及杂质进行分解，转化成自身所需要供自身生繁殖的营养物质，微生物得到了供养，恶臭分子也被分解了，人类与微生物达成了共赢。
生物除臭箱的适应范围分为三个方面，个方面是工业生产比如说化工、制药、造纸、锻造、油脂等；第二个方面是环境修复比如说污水处理、垃圾填埋场、堆肥场等；第三个方面是农牧的业生产加工比如说动物养殖号。
生物除臭箱的机理是利用纯生物填料层,在适当的温度下培养有用的能分解恶臭气体成分的微生物。玻璃钢结构的生物除臭箱特性主要包括污染源源头控制与收集、废气管路设计、预处理段、特异菌生物除臭床吸附分解主体、强化吸附段和排放系统。
对于废气，臭气的处理过程大概先把恶臭气体通入有效控制和收集输送进处理系统后，然后经过预处理去除废气，臭气中的明显杂质以及对于气体进行调温调湿，创造出生物分解适宜环境然后再进行特异菌微生物吸附分解，利用生物填料，在满足处理工艺条件下同时大限度的发挥特异菌作用，使目标污染物被有效分解去除，终达到恶臭的治理目的。
废气处理可以用uv光氧催化废气净化器和活性炭废气净化器共同去处理。对于uv光氧催化废气净化器来说，它是利用高能高氧uv紫外线光束分解空气中的氧分子，以此来产生游离氧又名活性氧，游离氧携带正负电子不平衡，所以会继续结合其他氧分子产生臭氧
而臭氧对于有机物来说具有极强的氧化作用，可以清除恶臭气体及其它刺激性异味的气体。然后处理后的气体再通入活性炭废气净化器中过滤吸附异味。活性炭本身具有高强度的吸附力，对于一些废气也可以进行很好的吸附作用。
废气处理也可以进行催化燃烧，催化燃烧废气处理设备是在催化剂的作用下，使有机废气中的碳氢化合物可以在温度较低的的环境下氧化成二氧化碳和水。
可以将有机废气先通过加热装备加热到200到400摄氏度之间，然后再通入燃烧室，在催化剂作用下，催化剂降低了反应的活化，能使碳氢化合物与氧分子可以较低的温度下氧化产生水和二氧化碳。
对于生物法来说，它是利用微生物对于废气，臭气中的恶臭物质的利用转化成为自身所需要的营养物质来进行废气，臭气的除臭工作的十分的环保，而且无二次污染。
微生物一般是一些复合的高效除臭生物菌种，然后再加上组合式填料，使得恶臭气体一旦接触到生物填料表面上的水膜就能够溶解在水中，恶臭气体中的营养成分就可以被吸附于生活填料上的高效除臭生物菌种所吸收和氧化分解成自身所需要的营养物质而利用.
与此同时恶臭气体也被分解了，微生物的生物除臭法在污水站的除臭工作实现了人类与微生物的双赢，是人类在于废气，臭气的处理中的又一重大的进步，一个新的里程碑。
生物滤池的原理是利用微生物的生理代谢功能，将具有臭味的物质加以转化成为自身所需要的营养物质，从而使废气臭气中的目标污染物被去除，从而达到治理恶臭气体的目的。那生物滤池对于废气，臭气的处理具体是怎样操作的呢？
首先，恶臭气体要经过预处理，预处理就是将需要处理的恶臭气体中的微小粒子去除，同时要对于废气，臭气进行调温加湿，让废气臭气可以更好的适用生物除臭箱的环境。
然后在生物滤池中会有许多的生物填料，生物填料中含有大量的微生物，当废臭气体经过不断的扩散运动扩散到介质外层的水膜从而使污染物被介质吸收，介质表面所附着的各种微生物将污染物分解成为自身生长繁殖所需要的营养物质以及分解成一些不会污染环境的二氧化碳，氧气，水等物质。